La plateforme technique de chromatographie et de spectrométrie de masse est composée de personnels APHM et s’intègre dans l’Unité Mixte de Recherche MEPHI.
L’équipe accompagne à la fois les microbiologistes de l’Hôpital et les chercheurs de l’IHU.
Elle développe son expertise suivant deux missions :
1/ Le Diagnostic Clinique : identification de micro-organismes (bactéries, levures, champignons, etc…) (Biotyper MALDI-TOF-MS) et dosage d’antibiotiques (UHPLC-UV).
2/ Développement de méthodes :
PROFILING : recherche de marqueurs correspondant à des maladies par MALDI-TOF-MS
PROTEOMIQUE : identification de protéines en mélanges complexes, évaluation de l’expression des protéines (protéomique relative par label free), séquençage de novo de peptides.
Petites molécules et métabolites : identification, caractérisation et dosage de petites molécules par chromatographie en phase liquide et gazeuse (gaz permanents, éthanol, COV, acides gras, acides aminés, pesticides, quinolones, lactones, antibiotiques, caroténoïdes, lipides polaires, glucides …)
Equipement
Biotypage :
7 MALDI-TOF-MS Microflex LT (Bruker 2010-2018)
Protéomique :
Robot Freedom EVO 100 (Tecan 2013)
NanoLC-QTOF Synapt G2Si (Waters 2013)
MALDI-TOF-MS Autoflex Speed (Bruker 2016)
Petites molécules :
HPLC-UV Alliance (Waters 2001)
UHPLC-UV/FLUO H-Class (Waters 2012)
Headspace-GC/MS (Perkin Elmer 2013)
GC-TCD (Perkin Elmer 2016)
UHPLC-IMS-QTOF iClass-Vion (Waters 2017)
Personnel AP-HM :
ARMSTRONG Nicholas (nicholas.armstrong@univ-amu.fr), Ingénieur Hospitalier : Diagnostic petites molécules et métabolites (GC/MS, LC/MS et LC-UV/FLUO),
COUDERC Carine (carine.couderc@univ-amu.fr), Ingénieur Hospitalier : Diagnostic et développements Biotyper (MALDI-TOF-MS)
DECLOQUEMENT Philippe (philippe.decloquement@univ-amu.fr), Ingénieur Hospitalier : Protéomique (MALDI-TOF-MS et LC/MS)
ROBINNE Simon (simon.robinne@ap-hm.fr), Ingénieur Hospitalier : Diagnostic et développements Biotyper (MALDI-TOF-MS)
