Présentation
Afin de renforcer notre position de leader dans la recherche sur les maladies infectieuses émergentes, nous avons réussi à obtenir un financement du Fonds Européen de Développement Régional (FEDER) 2021-2027 pour renouveler et compléter les équipements de nos plateformes. Ce soutien est crucial pour faire de l’IHU une locomotive régionale dans le domaine de recherche scientifique, en intégrant diagnostics, soins, et recherche sous un même toit.
Ce financement stratégique, également soutenu par le contrat de plan État-Région (CPER) 2021-2027, est essentiel pour concrétiser notre vision d’un institut hospitalo-universitaire ouvert à la collaboration avec la filière biomédicale et biotechnologique.
Financements
Financement total : 7 164 029.61 €
IHUPERF-1 : 900 000 €
IHUPERF-2 : 723 030 €
IHUPERF-3 : 1 191 886.37 €
IHUPERF-4 : 1 238 685.25 €
IHUPERF-1 : Plateforme de génomique
Comprendre les changements transcriptionnels localisés tout en prenant en compte l’architecture tissulaire nécessite des technologies spatiales (3D) à haute définition pour le profilage des gènes et des protéines. Pour cela, le séquençage spatial de l’ARN, variante de la génomique spatiale utilise la puissance des méthodes de séquençage à haut débit (NGS) pour profiler l’expression génique avec une résolution tridimensionnelle. C’est ce que l’on appelle le stéréo-séquençage, qui est au cœur du projet IHUPERF-1.
Ce projet s’appuie sur l’acquisition, l’installation et l’application au champ des maladies infectieuses de l’équipement de Stéréo-séquençage MGI Tech. Cet outil, totalement innovant et encore très peu répandu, permet l’étude du comportement individuel des cellules au sein d’un tissu par étude de son transcriptome. A ce titre, le stéréo-séquençage est parfaitement adapté à l’étude des processus infectieux et notamment de la réponse de l’hôte à l’agression microbienne.
L’implémentation de cette technologie au sein de la plateforme de génomique de l’IHU-MI lui permettra donc de réaliser un saut technologique majeur en matière de transcriptomique, ouvrant la voie à de nombreuses collaborations.
IHUPERF-2 : Plateforme de culturomique
Le projet IHUPERF-2 renforce notre capacité à étudier le microbiote humain en développant des techniques de culture cellulaire à haut débit et de microscopie électronique à balayage aussi bien en conditions NSB2 que NSB3. Afin d’atteindre nos objectifs de performance en matière de culturomique bactérienne il est indispensable que l’IHU-MI puisse acquérir des équipements complémentaires à ceux déjà existants dans des comme la microscopie électronique. Le caractère vieillissant de certains équipements (incubateurs et PSM) est aussi un autre axe d’amélioration du niveau de performance.
Grâce à ces nouvelles technologies intégrées à la plateforme NSB3, l’IHU Méditerranée Infection pourra continuer d’isoler et analyser des microorganismes difficiles à cultiver, permettant ainsi une meilleure compréhension des déséquilibres microbiens et de leur impact sur la santé.
IHUPERF-3 : Plateforme de protéomique
Il est aujourd’hui indispensable de procéder à un renouvellement du parc technologique de la plateforme protéomique de l’IHU, à l’introduction de nouvelles technologies et à la refonte des organisations en place afin de répondre de manière la plus efficace possible à des demandes internes croissantes des unités de recherche de l’IHU-MI mais aussi à des demandes externes d’autres unités de recherche et provenant aussi d’acteurs du monde économique, start-up ou industriels. Grâce à l’acquisition de nouveaux équipements de purification par chromatographie (FPLC) et d’un système d’analyse LC/MS de dernière génération, nous pourrons traiter des volumes plus importants et mener des analyses protéomiques, glycomiques et lipidomiques d’une précision inégalée.
Ces avancées renforceront non seulement notre recherche interne mais ouvriront également de nouvelles opportunités de collaboration et de prestation de services pour les entreprises, faisant de l’IHU un acteur clé dans le domaine de la protéomique.
IHUPERF-4 : Plateforme de sérologie
Le projet IHUPERF-4 vise à révolutionner la sérologie en automatisant la technique d’immunofluorescence, un procédé essentiel pour l’étude des infections. En intégrant l’automatisation à des processus tels que le dépôt précis des antigènes et la lecture des résultats, ce projet a pour objectif de rendre la sérologie plus efficace, reproductible, et adaptée au haut débit.
Cette innovation pourrait non seulement améliorer le diagnostic et le pronostic des maladies infectieuses, mais aussi positionner l’IHU comme un leader dans le développement de nouvelles technologies sérologiques, ouvrant la voie à de potentielles collaborations industrielles et dépôts de brevets.
IHUPERF-5 : biobanque
Le projet IHUPERF-5 se concentre sur l’amélioration et la modernisation de la biobanque de l’IHU Méditerranée Infection, essentielle pour la conservation à long terme de matériel biologique. Face à l’augmentation du volume des prélèvements cliniques, des acides nucléiques, et des souches de microorganismes pathogènes, ce projet prévoit l’acquisition d’équipements venant compléter le Biostore (-80°C) et le SampleStore (-20°C). Ces dispositifs, complétés par un système avancé d’aliquotage et de détection automatique des volumes d’échantillons, garantiront une conservation optimale et conforme aux normes techniques et réglementaires, tout en soutenant le développement de nouveaux tests diagnostiques.
Projet financé par le CPER
Co-financeurs et remerciements
Ces projets n’auraient pas été possibles sans les programmes de financement que sont :
> Le Fonds Européen de Développement Régional (FEDER)
> Le Contrat Plan Etat-Région porté par la Région Provence-Alpes-Côte d’Azur (PACA) et l’Etat et cofinancé par la Ville de Marseille, la Métropole Aix-Marseille Provence et Département des Bouches-du-Rhône
