Composition de l’équipe
L’équipe est composée d’un ingénieur hospitalier en microscopie électronique APHM
PRÉSENTATION
La plateforme de Microscopie Optique (MO) de l’IHU offre un gamme complète de microscopes optiques permettant de répondre aux besoins des utilisateurs de l’IHU dans le domaine des maladies infectieuses.
Les microscopes optiques de la plateforme permettent en effet des observations des plus grands micro-organismes comme les champignons jusqu’aux bactéries et aux virus, sur cellules fixées ou vivantes dans des flasques, boites de pétri ou lames (1,4,5,8,10-13). Les microscopes les plus simples permettent d’imager des colorations vitales sur lames, les plus perfectionnés d’illustrer des marquages fluorescents de micro-organismes ou cellules infectées, et éventuellement de suivre en temps-réel la dynamique de l’infection. Un poste dédié de micro-aspiration/micro-injection permet la manipulation des microbes (9).
La plateforme MO offre des formations théoriques et pratiques de différents niveaux sur les différents équipements, de l’acquisition au traitement et l’analyse des images. L’accent est mis sur l’innovation avec le développement de méthodes de microscopie corrélative optique- électronique (CLEM) (2,3,14).
La plateforme MO s’implique activement dans diverses collaborations scientifiques (6,7). La manipulation des microscopes s’effectue suivant les bonnes pratiques de laboratoire, avec l’appui de la cellules Hygiène et Sécurité du laboratoire ; la microscopie optique des micro-organismes hautement pathogènes (règlementation MOT) s’effectue dans le laboratoire NSB3 (CD7 Zeiss ; IHU).
EXPERTISE
La plateforme MO de l’IHU propose une offre de service pour l’accès aux microscopes optiques et des partenariats avec les entités publiques ou privées dans le cadre de projets collaboratifs.
Colorations vitales.
Epifluorescence et microscopie confocale a balayage laser (CLSM) de marqueurs fluorescents : (Immuno histo- cyto- chimie) ; Hybridation In-Situ (FISH) ; Colorants fluorescents.
Vidéo-Microscopie en temps-réel.
ÉQUIPEMENT ET TECHNOLOGIES
Les équipements disponibles sont :
- Microscope confocal Airyscan LSM800 (Zeiss; IHU).
- Microscope inversé Eclipse TE-2000S (NIKON ; APHM) équipé micro-aspiration/micro-injection (Eppendorf).
- Microscope à épifluorescence DMI 2500 (Leica ; APHM).
- Microscope à épifluorescence AxioObserver Z1 (Zeiss ; IHU).
- Microscope à épifluorescence DMI3000B (Leica ; IHU).
- Loupe Axio Zoom V16 (Zeiss ; IHU).
- Microscope Celldiscoverer CD7 (Zeiss ; IHU) en zone NSB3.
RÉALISATIONS
- Andrieu J, Valade M, Lebideau M, Bretelle F, Mège JL, Wurtz N, Mezouar S, La Scola B, Baudoin JP. Pan-microscopic examination of monkeypox virus in trophoblasts cells reveals new insights into virions release through filopodia- like projections. J Med Virol. 2024 Apr;96(4):e29620
- Brahim Belhaouari D, Baudoin JP, Lagier JC, Monnet-Corti V, La Scola B, Antezack A. Microscopic observations of SARS-CoV-2 like particles in different oral samples. Eur J Oral Sci. 2022 Dec; 130(6):e12903.
- Le Bideau M, Robresco L, Baudoin JP, La Scola B. Concentration of SARS- CoV-2-Infected Cell Culture Supernatants for Detection of Virus-like Particles by Scanning Electron Microscopy. 2022 Oct 28;14(11):2388.
- Osman IO, Garrec C, de Souza GAP, Zarubica A, Belhaouari DB, Baudoin JP, Lepidi H, Mege JL, Malissen B, Scola B, Devaux CA. Control of CDH1/E-Cadherin Gene Expression and Release of a Soluble Form of E-Cadherin in SARS-CoV-2 Infected Caco-2 Intestinal Cells: Physiopathological Consequences for the Intestinal Forms of COVID-19. Front Cell Infect Microbiol. 2022 May 4; 12:798767.
- Aherfi S, Brahim Belhaouari D, Pinault L, Baudoin JP, Decloquement P, Abrahao J, Colson P, Levasseur A, Lamb DC, Chabriere E, Raoult D, La Scola B. Incomplete tricarboxylic acid cycle and proton gradient in Pandoravirus massiliensis: is it still a virus? ISME J. 2022 Mar; 16(3):695-704.
- Bestion E, Zandi K, Belouzard S, Andreani J, Lepidi H, Novello M, Rouquairol C, Baudoin JP, Rachid M, La Scola B, Mege JL, Dubuisson J, Schinazi RF, Mezouar S, Halfon P. GNS561 Exhibits Potent Antiviral Activity against SARS-CoV-2 through Autophagy Inhibition. 2022 Jan 12;14(1):132
- Brun S, Bestion E, Raymond E, Bassissi F, Jilkova ZM, Mezouar S, Rachid M, Novello M, Tracz J, Hamaï A, Lalmanach G, Vanderlynden L, Legouffe R, Stauber J, Schubert T, Plach MG, Courcambeck J, Drouot C, Jacquemot G, Serdjebi C, Roth G, Baudoin JP, Ansaldi C, Decaens T, Halfon P. GNS561, a clinical-stage PPT1 inhibitor, is efficient against hepatocellular carcinoma via modulation of lysosomal functions. Autophagy. 2022 Mar; 18(3):678-694.
- Otmani Idrissi M, Baudoin JP, Chateau AL, Aherfi S, Bedotto-Buffet M, Latil A, Lepidi H, Chiaroni J, Picard C, Mege JL, La Scola B, Mezouar S. Presence of SARS-CoV-2 in a Cornea Transplant. 2021 Jul 24;10(8):934.
- Sahmi-Bounsiar D, Baudoin JP, Hannat S, Decloquement P, Chabrieres E, Aherfi S, La Scola B. Generation of Infectious Mimivirus Virions Through Inoculation of Viral DNA Within Acanthamoeba castellanii shows Involvement of Five Proteins, Essentially Uncharacterized. Front Microbiol. 2021 Jul 9; 12:677847.
- Pires de Souza GA, Osman IO, Le Bideau M, Baudoin JP, Jaafar R, Devaux C, La Scola B. Angiotensin II Receptor Blockers (ARBs Antihypertensive Agents) Increase Replication of SARS-CoV-2 in Vero E6 Cells. Front Cell Infect Microbiol. 2021 Jun 11; 11:639177.
- Brahim Belhaouari D, Wurtz N, Grimaldier C, Lacoste A, Pires de Souza GA, Penant G, Hannat S, Baudoin JP, La Scola B. Microscopic Observation of SARS-Like Particles in RT-qPCR SARS-CoV-2 Positive Sewage Samples. Pathogens. 2021 Apr 24; 10(5):516.
- Hannachi N, Baudoin JP, Prasanth A, Habib G, Camoin-Jau L. The distinct effects of aspirin on platelet aggregation induced by infectious bacteria. Platelets. 2020 Nov 16; 31(8):1028-1038.
- Brahim Belhaouari D, Baudoin JP, Gnankou F, Di Pinto F, Colson P, Aherfi S, La Scola B. Evidence of a Cellulosic Layer in Pandoravirus massiliensis Tegument and the Mystery of the Genetic Support of Its Biosynthesis. Front Microbiol. 2019 Dec 20; 10:2932.
- Baudoin JP, Hari S, Sahmi-Bounsiar D, Traore SI, Bou-Khalil J, Andréani J, La Scola B. Correlative light electron microscopy of giant viruses with the SECOM system. New Microbes New Infect. 2018 Sep 20;26:110-113.
