1 – La plateforme Bioinformatique
Responsable d’équipe :
Prof. Anthony LEVASSEUR anthony.levasseur@univ-amu.fr
Description de la plateforme Bioinformatique :
La plateforme Bioinformatique est spécialisée dans les analyses génomiques et évolutives à partir des données -omics et dans les validations fonctionnelles. Le personnel AP-HM travaille sous la direction du Prof. Levasseur.
L’équipe de Bioinformatique accompagne à la fois les biologistes de l’Hôpital et les chercheurs de l’IHU. Son expertise repose sur :
- Le diagnostic clinique et la recherche: identifications phylogénomique et évolutive de bactéries, virus, eucaryotes, parasites, champignons, CPR, Coronavirus, etc… Expertise du contenu génomique en liaison avec le pouvoir pathogène, transmission, génomes et évolution clinique patients, résistance antibiotiques, etc…
- Développement de méthodes « à façon » selon les projets de recherche. Création et mise en place de méthodes et pipelines dédiés. Nos développements s’appuient sur les outils bioinformatiques et les concepts de l’évolution biologique.
- Traitements des Big Data en liaison avec les données NGS et les databases mondiales.
Personnel AP-HM :
- Informaticien : Sylvain Buffet
- Bioinformaticienne : Aurélia Caputo
- Bioninformaticien : Jérémy Delerce
